房屋的性质以产权登记为准，经济适用房土地性质是划拨，5年后可以上市交易，交易后要补交土地出让金，过户后土地性质就变为出让土地了，产权登记上会注明土地性质的，如再遇拆迁就以新的产权登记补偿。而没有进行土地变更的房屋土地仍然没有补偿，可重新调换经济适用房给你产权调换，也可以只补偿地面建筑物重置价格进行贷币补偿。当然补偿方案也可能先补足土地出让金再进行按普通商品房补偿，肯定有多种方案供你选择的。
你在哪座城市，各地规定不同。
