如果你现在是集体户口,那档案和户口必须一起迁。不能单独迁户口也不能单独迁档案。如果你现有不是集体户口,那就无所谓要不要一起迁,只要对方肯接收就行。你可以办改派,改派到深圳就可以了。不过,你现在的情况,毕业还没超过两年,如果想要落户深圳,那最好是档案和户口一起迁到深圳,最好不要分开办理。另外,这里说的一起,是说一起迁到深圳,而不是先放一起再迁到深圳。
你户口现在转不到深圳,深圳对于外来务工人员户口问题卡的很严,好像采用的是积分制,反正挺麻烦的。至少最近几年你是无法落户深圳的。