全国股份转让系统是经国务院批准成立的全国性证券交易场所，天津股权交易所是区域性的市场，虽然天津股权交易所现在在跨区域经营，二者的根本区别在于区域性市场要受国发【2011】38号文限制；在全国股份转让系统挂牌的企业是纳入证监会统一监管的非上市公众公司，股东人数可以超200人，在区域性股权交易市场挂牌的是非上市非公众公司，股东人数不可以超200人；股票在全国股份转让系统交易是标准化的，交易方式有协商、做市商、集合竞价，在区域性市场的交易是非标准非连续的；企业在全国股份转让系统挂牌后，股票可以公开转让、定向发行。
全国股份转让系统公司是三板，天津是区域性股权交易市场，是天津的四板
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