A、水的光解:H2O→[H]+O2,属于光反应中发生的物质变化,其场所为类囊体薄膜,A正确;B、在光合作用暗反应阶段,光反应产生的ATP要用于三碳化合物的还原,因此反应ATP→ADP+Pi+能量,发生在叶绿体基质中,B错误;C、暗反应阶段中,三碳化合物会还原成糖类等有机物,以及重新形成五碳化合物,其场所为叶绿体基质,C错误;D、暗反应中,二氧化碳和五碳化合物会固定产生三碳化合物,其场所为叶绿体基质,D错误.故选:A.