A、非同源染色体间片段的交换会导致染色体片段的易位，属于染色体结构变异中的一种，A正确；B、有丝分裂后期子染色体不分离会导致产生的细胞的染色体数目增加或减少，是染色体数目变异，B正确；C、同源染色体上非姐妹染色单体交叉互换会导致基因重组，C正确；D、基因突变会引起基因结构的改变，不改变基因的数目和排列顺序，D错误．故选：D．
