A、基因突变可以产生新基因，同时产生新的基因型，A正确；B、基因重组是有性生殖过程中，控制不同性状的基因之间重新组合，B正确；C、同源染色体之间发生的交叉互换属于基因重组，非同源染色体之间发生的交叉互换属于染色体结构变异中的易位，C错误；D、猫叫综合征是由于患者第五号染色体部分缺失引起，属于染色体结构变异，D正确．故选：C．
