私营企业利润分配主要根据双方投资协议的约定，目前法律上是原则意见。收入扣除成本费用后，上交企业所得税，提取盈余公积，弥补上年度亏损，再按股东出资比例分配。盈利与注册资本没有直接关系法人不通过合法分配程序拿走盈利是违法行为（职务侵占罪），可以从法律途径加以解决，要求法人返还公司财产。未分配的盈利是公司财产，与股东个人无关。要保障小股东利益，要求公司所有股东严格遵守公司法和公司章程。
