当发现鱼体感染水霉病时，可用3％食盐水浸洗，每天1次，每次5～10分钟，或用百万分之二(2ppm)的高锰酸钾溶液加l％食盐浸泡20～30分钟，或用百万分之一至二(1～2ppm)的孔雀石绿溶液浸洗20～30分钟，或用百万分之一至二(1～2ppm)的次甲基蓝溶液浸泡20—30分钟，或用百万分之五(5ppm)的呋喃西林溶液浸洗，或用百万分之零点零二(0.02ppm)的孔雀石绿溶液、百万分之零点三(0.3ppm)的甲醛溶液直接泼洒入水族箱，以抑制霉菌的孳生。还可用提高水温以抑制水霉的生长。在水族箱顶端安装一盏15瓦的紫外线灯，每日照射数小时，可有效地抑制或消除水霉的孳生。
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