科技型中小企业技术创新基金是经国务院批准设立，用于支持各地科技型中小企业技术创新的政府专项基金。省级创新基金主要支持一般创新、科技型中小企业公共服务补助等项目。他们所涵盖的范围有所不同。也可以说市科技型中小企业创新基金是省创新基金的一部分。
你说的可能是一回事。只是两个部门，最后都要报到国家科技型创新基金中心评审。
没有特定的隶属关系，就是范围不一样而已，给你一个网站http://www.innofund.gov.cn/
