如何进行系统进化树的构建和分析? 我这有测好的基因序列,但是不知道该怎么构建系统进化树,求高人指点。

2024-12-23 15:59:53
推荐回答(2个)
回答1:

首先你需要一个能够对序列进行编辑的软件(比如Mac系统的MacGDE、WIndows的BioEdit、Mega、Genuis、ClusterX等)对整个数据库排序(Alignment),就是把相似的位点放到一起去。
同时你要决定构建树用的方法,一般来说用Maximum Likelihood(Paup)、Bayesian(Mr Bayes),不过在此之前先用Neibour-Joining(快速,不准确)看一看大概情况也是必要的

然后就是把数据库里有Gap的部分切掉,然后放到构建树的程序(Paup、MrBayes等)去做树

具体方法见那些软件的说明书……

回答2:

给你介绍个软件DNAman使用多重序列比对功能就可以构建系统进化树了