如果两对基因位不位于同一对染色体上，那就不能自由组合了。
比如AAbb 和 aaBB杂交，如果A与b位于一条染色体上，那AAbb 和 aaBB形成的两种配子结合后的子一代是AaBb，子一代形成配子只有两种（不考虑同源染色体的交叉互换），即Ab和aB，子二代基因型的比为：AAbb ：AaBb：aaBB=1：2：1。
而如果两对等位基因不位于一对同源染色体上，则F2基因型的比为：
A-B-：A-bb ：aaB-：aabb=9：3：3：1。
这就是区别。
两对基因位于同一对染色体上就是完全连锁啊
位于不同对染色体上就是孟德尔遗传定律啊
这个问题问的不具体，楼主如果真不懂，可以详细的问，，楼主知道不知道一对基因的遗传规律，如果一对的知道了，那么2对的顺其自然也就知道了。、
下面回答楼主的那个实例：AAbb与aaBB杂交F1代为AaBb，F1自交的后代结果就是Aa自交的结果与Bb自交的结果的自由组合。比如子二代的基因型就是(AA、Aa、aa)与（BB、Bb、bb）组合，所以共9种基因型，性状比为（3:1）乘以（3:1）所以为9:3:3:1.。楼主不懂再追问
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