隶属海关是指由直属海关领导,负责办理具体海关业务的海关。
《海关法》规定，国务院设立海关总署，统一管理全国海关。海关机构的设置一般分为海关总署、直属海关和隶属海关三级。海关实行垂直领导的体制，即隶属海关由直属海关领导，向直属海关负责；直属海关由海关总署领导，向海关总署负责。海关按照《海关法》和国家有关法律、法规，在国家赋予的职权范围内自主地、全权地行使海关监督管理权，不受地方政府（包括同级党的机构）和有关部门的干预。
也就是可能某个地区，比如某省某市与隶属海关不在同一个省，这样子就形成了实际上海关有隶属关系，但行政区划上，大家却互相管不着，再简单点就是，隶属上级海关能下指示给这个市的海关，但隶属上级海关所在的省却管不了隶属下级海关所在的市
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