首先，基因重组是造成基因型变化的核酸的交换过程。基因的自由组合定律是遗传学的三大定律之一 。基因的自由组合是造成基因重组的一种原因。都使得生物体内基因发生变化。从广义上讲，任何造成基因型变化的基因交流过程，都叫做基因重组。而狭义的基因重组仅指涉及DNA分子内断裂—复合的基因交流。自由组合，只是基因搭配发生变化，但是没有它不涉及DNA分子内的断裂复合，因此，不包括在狭义的基因重组的范围之内。
