1、你说的国务院的文件是什么文件，是国务院以行政法规定的 形式发布的，还是仅仅只是一个通知或者是国务院某一个部门发布的？
2、合同只有在违反了法律与行政法规的才无效，其他的都是有效的，这个就是充分尊重当事人意思自治的需要，也是为了维护交易安全的需要。也就是说合同只有在违反了全国人大及常委会制定的法律及国务院制定的行政法规的，才是无效，其他的都是有效的。
3、所以，你这个文件不太清楚到底是什么文件，如果不是国务院的行政法规，则你的合同是有效的，按照你的合同上规定的执行，如果没有规定，则按照国家及地方有关规定执行。
您好：
原则上应当以合同约定为准；但如果合同价款包含了这笔费用，又确实符合文件的规定，应参照文件执行。
仅供参考！
合同条款违法国家法律和政策规定的，是无效条款，所以可以不交。不过合同是有效的。
应该以国家文件为准
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