看是什么性质什么程度的违纪，是否造成重大损失。一般不是违反法律，公司不会记入个人档案。
小违纪没人会追究你了，并且个人档案私人公司是无权修改添加的，国企的话还有可能。
看你的公司是什么性质的，还要看你犯的错误级别，如果达到刑事案件或者影响特别恶劣的话就挺不好的，不过还要看你单位的级别，如果是国家企事业单位，有可能会记入档案。
只要不去公安局就没事，放心吧
