ISO 9001 与TS16949体系要求中 不是同一生产lot的产品 能装一个箱子吗

不可以，
ISO9000与TS16949标准7.5.3条款：
标识和可追溯性的主要内容是：
适当时，组织应在产品实现的全过程中使用适宜的方法识别产品。组织应在产品实现的全过程中，针对监视和测量要求识别产品的状态。在有可追溯性要求的场合，组织应控制产品的唯一性标识，并保持记录。（见4.2.4）
注：在某些行业，技术状态管理是保持标识和可追溯性的一种方法。
ISO9000标准7.5.3条款：标识和可追溯性的理解要点是：在产品实现过程中，存在有不同的产品，对各类产品的监视和测量过程中存在不同的状态，有些产品需要对产品的历史、应用情况等进行追溯，这些都需要在产品实现过程中使用标识加以区分。本条款中所涉及的标识有：产品标识，状态标识，唯一性标识。
不同LOT的产品，产品的历史情况，应用情况是不一样的，比如，材料供应商不同，生产设备不同，工装夹具不同，生产人员不同等等。每一批次抽检结果不同，如数据的波动，发现过的不良等等，故不是同一生产lot的产品不能装一个箱子

只要能追溯或标示清楚,不用限定出货的包装,如果是制程的移动就要分开来

当然可以,ISO9000与TS16949标准7.5.3条款 标识和可追溯性的主要是具可追溯性
但如果无法追溯的话那就不可以
如果都不可以那如何定义Lot,材料换批/人员换班/设备生产中更换治具,一定会造成出货大乱