第一任妻子黄建萍：他的第一任妻子叫黄建萍，与他同是中国儿童艺术剧院的演员，后来去世了。
第二任妻子张晞：许亚军的第二任妻子非常贤良淑德，叫张晞，主演过电影《豆蔻年华》，还有电视剧《京都纪事》。两人的生活一度非常幸福。
不过后来，许亚军与何晴拍《风荷怨》时擦出火花，许亚军为了与何晴早日在一起，迫使张晞与他离婚，差点害得妻子心脏病发。
第三任妻子何晴：1995年，许亚军接拍《风荷怨》，演对手戏的就是何晴，许亚军比何晴小3岁，两人迸发出爱的火花并导致许亚军离开了张晞，何晴也结束了她与刘威5年的恋情。据他们的朋友透露，许亚军与何晴结婚后曾非常相爱，被看作是演艺圈的神仙眷侣。尤其是2001年两人的爱情结晶仔仔的降生，更为他们的生活增添了很多乐趣。
儿子结合了爸爸妈妈的优点，非常可爱，不过到底没能留住父母的长久婚姻。2005年1月初，何晴宣布两人已于03年非典时离婚。至于离婚的原因，何晴和许亚军两人都不愿多说什么。
许亚军现任妻子张澍：许亚军和太太张澍是在拍戏时相识的，后来因高尔夫而结缘。2003年，许亚军和张澍各自走进了高尔夫球场。当时他们还不认识对方，就算见面也是擦肩而过。
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