不会影响成绩的。
其实你被准考证什么专科本科误导了，不管是专科还是本科的准考证，他都是一个你自考的凭证，你的成绩记录在里面，只要你参加的是自考不管你考的是什么科目，成绩都是有效的，合并准考证只是把分别在俩个准考证上的成绩都放到一个准考证上而已，然后剩下那个就作废了，你能不能拿毕业证是和你是否考过所有规定需要通过的课程。
随便拿哪个合并哪个都没事，没影响的。
你是有两个准考证号还是什么?如果大专本科是同一个准考证号的不用合并,可以申请大专毕业,你本科段成绩和大专段成绩一样在,如果广东的话,成绩暂时没有期限一直保留在准考证里面,如果你准考证过期,拿8元去自考办换一张新证就可以继续.
简单 办理一次合并 将专科准考证的全部成绩（含本科）合并到本科准考证上，或反过来，将本科准考证的全部成绩（含专科）合并到专科准考证上，然后你就用有全部成绩的准考证，以后考试也用这张目的准考证，考完后办理专科、本科毕业。
都可以。轻轻松松就可以搞定了
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