细菌鉴定的基本原则是什么?

细菌鉴定是指将分离培养获得的病原菌，通过纯化培养使其达到不含有其他微生物的纯培养程度，继而进行系统鉴定。而菌种保藏机构在收集一些已经冻干的菌种时，应在开启后经过两代的适应性培养方可进行复核性的系统鉴定。系统鉴定是通过细菌的形态结构、生长特性、抗原性、病原性以及目前流行的核酸测定方法等检测，并用已知标准免疫血清确定分离细菌的属、种和型(群)。目前菌种保藏机构通常使用的细菌鉴定方法大致有以下几种：

1、传统方法

常规宏观菌落形态学观察，主要观察菌落在其适合的培养基上的生长状况：细菌在固体培养基上的生长形态、大孝颜色是否均匀一致，菌落个体表面及边缘的生长状况;在液体培养基上的浑浊状况、沉淀状况、液面菌膜状况;半固体上穿刺接种后，观察细菌是否沿着接种线生长以及其生长状态是呈毛刷样生长还是均匀生长，上下生长是否一致。在鉴别培养基上培养。

细菌的个体形态学观察，即通过显微镜观察。观察前细菌需要着色，要根据预先确定的观察项目选择与之相对应的染色方法，目前常用的染色方法包括革兰氏染色法、美蓝染色法、Ziehl—Neelsen染色法、姬姆萨染色法、鞭毛染色法、芽胞染色法等。尽量挑选对数生长期的细菌进行染色观察，此时的细菌生长处于幼期，利于观察，因为一些陈旧细菌的染色结果会有变化，如本为革兰氏阳性菌经过长期搁置后染色结果可能为革兰氏阴性。同时细菌培养时要注意培养基的挑选，一些细菌的特殊结构如荚膜、鞭毛、菌毛、芽胞等，其表达是需要在特定的培养基上才能正常发育，有的细菌如炭疽在一般的培养基上不形成荚膜，只在动物体内形成明显的荚膜，所以需先接种实验动物后用病料进行涂片镜检。在镜检时观察细菌基本形态结构和大小及其排列状态、菌端形状、有无两极染色、有无形成芽胞和荚胞等。

细菌鉴定的基本原则是通过细菌的形态结构、生长特性、抗原性、病原性以及目前流行的核酸测定方法等检测，并用已知标准免疫血清确定分离细菌的属、种和型。
细菌鉴定提取基因组DNA，然后PCR扩增16s rDNA片段，上GeneBank对比即可。一般序列相似度在97%以上就可以认为是同种细菌。常规鉴定内容有形态特征和理化特性。形态特征包括显微形态和培养特征；理化特性包括营养类型、碳氮源利用能力、各种代谢反应、酶反应和血清学反应等，可以检测微生物的特征指纹图谱，建立与微生物种类相对应的数据库。通过软件将待测微生物与数据库参比，得出鉴定结果。

细菌鉴定基本原则：
一、菌种鉴定目的
通过形态特征、理化特性、遗传进化角度等阐明微生物种群之间的分类学关系，确认菌种的身份。
二、菌种鉴定方法
菌种鉴定一般就只要提取基因组DNA，然后PCR扩增16s rDNA片段，上机测序之后，上GeneBank或者Eztaxon对比即可。一般序列相似度在99%以上就可以认为是同一个种细菌。
三、DNA测序流程
（1）基因组DNA提取和检测
（2）16SrDNA/18SrDNA扩增
（3）产物纯化，上机测序，序列比对分析