法院的管辖分为协议管辖与法定管辖。
法律明确规定了管辖的法院的，当时人协议改变法定管辖无效。正如你所说的该条款，是侵权纠纷的法定管辖，当事人不能协议改变。另外，还如不动产纠纷由不动产所在地法院管辖。
另外，如在签订协议的时候，约定了相应的管辖条款，事后发生了合同纠纷与侵权纠纷的竞合，发生纠纷要看你以什么理由去诉讼。
如以合同纠纷诉，按合同管辖的规定处理。
如以侵权纠纷诉，则以侵权管辖的规定处理。
是合法的。适用《合同法》。只要协议适用法律符合：侵权行为地法律；当事人有共同经常居所地的，适用共同经常居所地法律。
侵权发生后协议解决，这是作为解决没有协议侵权适用法律的补充。
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