法院如何执行被执行人仅有的两套房产给申请人

法院可以通过强制执行被执行人的房产给申请人。申请人与被执行人协商以房产抵付债务的，法院可以不经拍卖，直接裁定以物抵债。双方未能协商以房抵债的，法院会通过拍卖程序拍卖房屋。如果拍卖成功，法院将拍卖款交付申请人以偿还债务。无法拍卖的，如申请人愿意以房抵债，法院可以裁定以房抵债给申请人。
法律分析
人民法院按照法定程序，运用国家强制力量，根据发生法律效力文书明确具体的执行内容，强制民事义务人完成其所承担的义务，以保证权利人的权利得以实现。发生法律效力的文书包括但不限于以下几种：民事判决书、实现担保物权裁定、确认调解协议裁定、支付令等。一经生效，义务人即应自动履行。如拒不履行，权利人可申请人民法院强制执行。通过判决，需要承担对应执行义务的人员，进入执行程序时，都可以称为被执行人而失信被执行人，则是在被执行人基础上，通过手段使无法执行，使执行人的合法权益得不到保障，而被执行人实际上是有能力执行的如：恶意隐匿、转移财产，采取玩消失等手段，拒不执行甚至采取暴力抗法的手段阻挠执行等失信被执行人会被纳入征信系统。
法律依据
《中华人民共和国民事诉讼法》 第二百四十二条被执行人未按执行通知履行法律文书确定的义务，人民法院有权向有关单位查询被执行人的存款、债券、股票、基金份额等财产情况。人民法院有权根据不同情形扣押、冻结、划拨、变价被执行人的财产。人民法院查询、扣押、冻结、划拨、变价的财产不得超出被执行人应当履行义务的范围。人民法院决定扣押、冻结、划拨、变价财产，应当作出裁定，并发出协助执行通知书，有关单位必须办理。

对被执行人的房产，法院可以通过以下途径进行强制执行：
1、申请人与被执行人协商以房产抵付债务的，法院可以不经拍卖，直接裁定以物抵债。
2、双方未能协商以房抵债的，法院会通过拍卖程序拍卖房屋。如果拍卖成功，法院将拍卖款交付申请人以偿还债务；无法拍卖的，如申请人愿意以房抵债，法院可以裁定以房抵债给申请人。

法院下达判决后，如果对方提出了强制执行的申请，法院会先查封扣押被执行人的财产，并进行估价，然后对比需要赔偿的金额，对被执行人财产进行选择，但是对于不动产来说，法院应当至少留给被执行人一套用于其生活居住的不动产。之后，法院对选定的那套被执行财产，在房产登记部门强制变更房产所有权，变更至法院名义下，然后在择期进行拍卖或变卖。之后将卖得的金额赔偿给申请人，多余的部分会退给被执行人。

如被执行人有两套房产，法院执行庭在查封被执行人房产后,如被执行人仍不履行生效法律文书的,法院可以通过最委托评估、拍卖和变卖被执行人一套房产的程序实行申请人的权利.

依据：《民事诉讼法》及《最高人民法院关于人民法院委托评估、拍卖和变卖工作的若干规定》
《最高人民法院关于人民法院民事执行中查封、扣押、冻结财产的规定》等