我想做一个容量1000VA，输入12V输出500V的变压器该怎么做啊，一二次要绕多少圈线，线径多大磁心怎么做。

先计算选型。如果按常规的工频50赫兹来计算明显不对。虽然你的意思表达不清楚，很可能是输入部分是电瓶等直流电，输出是500伏交流电，用来捕鼠、捕鱼、捕鸟等用途。这类东东有现成的成品卖，了解一下它的原理、使用和保养即可，不必要制造，因为全手工单独制作，成功率不高，造价却很高。它牵涉振荡、升压、变压等过程，而且，材料很不好准备齐全。
因为您的电源是12伏，1000VA的机器，输入电流大约是80A，考虑效率的话，实际电流可能超过100A。与之配套的电源体积和重量很大，造价肯定很高。机器本身的功率部分，仅常用的振荡晶体管就需要30只并联使用，其散热器体积巨大。
实际上，现实存在的UPS电源，它解决这个问题的办法是输入电压较高，很多采用48伏甚至80伏电源，输出同等功率，电流值减小很多，体积、重量和造价都可以下降了，能够进入实质性使用阶段。
还有：大型捕鱼船的电拖网，采用的是柴油发电机组，直接升压，功率和电压都有稳定的输出。

如果真的要做一个工频1000VA的变压器，选用铁芯截面积是60*80毫米，形状不拘。初级选用3*25mm扁铜线绕制13匝双线并绕；次级选用直径1.5mm左右的电磁线绕510匝。

用费旧电焊机改就好了，选1200瓦左右的，带机械开关那种，看一下它的空载负载电压，计算出每伏匝数，数据就出来了

你可参考：电气资料健康网，小型变压器制作，找1000VA的数据，按参数制作即可。