一个物种的cds序列可以用来设计荧光定量PCR的引物吗?求高手指点迷津啊,先谢谢了!!!!

2025-02-02 13:49:12
推荐回答(3个)
回答1:

可以啊 只要是mRNA上的就可以了 一般扩增产物长度150-200最好

回答2:

如果是用SYBR Green来做。设计的时候要跨外显子的交界区。这样能尽量避免扩增样本中残留的基因组DNA。

转录的时候,外显子和内含子一起被转录,这是序列和基因组DNA一样。剪切后才成为成熟RNA。如果设计引物的时候,至少有一个引物正好跨外显子的交界区。那么只有剪切后的RNA(cDNA)序列才能有效扩增。所以,使用cds序列的时候,先要做一下BLAST,找出交界区,定点设计。

回答3:

可以。这就是传说中的qRT-PCR