清祖制生母为圣母皇太后，先皇皇后为母后皇太后，两个太后其实很正常，慈禧之前并不是皇后但是生了唯一的阿哥大清继承人所以以后顺理成章是太后，慈安之前是皇后但是没有儿子但是毕竟是正室，所有妃嫔的孩子都是她的孩子她是所有皇子皇女的嫡母，无论谁继位都要尊其为皇太后所以同治生母慈禧太后为圣母皇太后，先皇的皇后慈安太后为母后皇太后。并不是说之前有两个皇后，同治继位生母自然不可以只是太妃。
你应该问说咸丰帝为啥有两个皇后才对。因为清朝何止只有两个皇后，慈禧与慈安两位太后，慈安本来就是咸丰的皇后，咸丰死後慈安当太后是理所当然的，而慈禧的为咸丰生了一个儿子，也是唯一的儿子，咸丰死後，让这个儿子成为皇帝-同治皇帝，身为生母的慈禧理应也会成为太后了。
在顺治帝时期也出现了两个太后的，
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