差不多吧，单纯从专业角度来讲，南理工自动化要比电子科大强一些，而且南理工就业偏重于国防军工方面。院校综合实力电子科大比南理工稍微强一点，但是南理工地缘优势比电子科大要强。所以总体难度差不多。南理工自动化专业是比较好的，是学校的王牌专业之一，比较有名。
