不会的。农村户口都能办农村合作医疗，如果在此基础上再办一份商业保险这两份保险在赔保上不仅不会引起冲突，反而在发生医疗费用时有两家赔保，可给农民朋友多一份保障。
新农合和商业医疗保险报销是不冲突的。
一般新农合的报销流程主要是：
在门诊报销的流程是：参加过新农合的患者持合作医疗证或者医疗卡到相关定点门诊就诊后，医生可以在合作医疗证上填写就诊记录，参保病人在门诊就诊时填写好登记表、门诊报销汇总表等，所有的表格填写详细并签完字后，可以向当地的负责办理新农保门诊报销的单位交完资料后申请报销。
需要住院的报销流程是：患者入院(提供合作医疗证、身份证)看病(新农合办事处人员检查合作医疗证、身份证)专用窗口办理出院领取补偿。
而商业医疗保险报销流程是：
一、额外补充费用报销型保险的人群
根据社会保险优先于商业保险的原则，一般由社会医疗保险支付后，保险公司再对剩余部分医疗费进行理赔。
保险公司会先根据保险条款确定可以赔付的项目(一般和社保的理赔范围一致)，再扣除社保已经赔付的额度，得到实际赔付数。
互补
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