在你说的这种情况下，计算土地增值税的关键是要确定扣除项目的金额。扣除项目金额包括以下四项：（1）房屋及建筑物的评估价格；（2）取得土地使用权所支付的地价款；（3）按国家统一规定缴纳的相关税费；（4）转让环节缴纳的税金。
根据财税字［1995］061号文件、国税发［1996］4号文件和国税发［1996］48号文件的规定，需要根据房地产的评估价格计税的，可委托经政府批准设立的资产评估机构对有关房地产进行评估。
旧房及建筑物的评估价格，是指在转让已使用的房屋及建筑物时，由政府批准设立的房地产评估机构评定的重置成本价乘以成新度折扣率后的价格。评估价格须经当地税务机关确认。
重置成本价的含义是：对旧房及建筑物，按转让时的建材价格及人工费用计算，建造同样面积、同样层次、同样结构、同样建设标准的新房及建筑物所需花费的成本费用。成新度折扣率的含义是：按旧房的新旧程度作一定比例的折扣。
由于旧房及建筑物的评估价格之中包含了建筑物的成本，所以，计算土地增值税扣除项目的时候不再扣除建筑物的成本了。
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