A、一种培养基上可以长出多个菌落，A错误；B、真菌形成的菌落有时呈现明显的颜色，不是都呈现明显的颜色，B错误；C、菌落是由单个或少数细菌或真菌在固体培养基上大量繁殖形成的，属于同种细菌．C错误；D、菌落是指一个细菌或真菌在适宜的培养基上繁殖后形成的肉眼可见的集合体（细菌或真菌集团）．D正确．故选：D
