按9月份的工资：并不是说只要是你在账务处理上是9月份以后发放的就按照3500的基数进行计算扣除，按照权责发生制原则，当期的工资薪金你已经做了成本及费用处理，相应的个人所得税也应该按照所属期的扣除标准计算扣除，不然的话会有许多单位和个人为了逃避该部分税收而故意滞后发放。
9月1日起发的工资就按新的标准执行。譬如说8月份的工资在9月5日发，按新标准执行，扣3500元基数。
9月以后发放
以实际取得时间为准
