国务院商务主管部门及省、自治区、直辖市人民政府商务主管部门是商业特许经营的备案机关。在省、自治区、直辖市范围内从事商业特许经营活动的，向特许人所在地省、自治区、直辖市人民政府商务主管部门备案；跨省、自治区、直辖市范围从事特许经营活动的，向国务院商务主管部门备案。
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2009年之前都是在商务部备案的，后来商务部权力下放，内资企业一般在各自所在省份商务主管部门备案。备案的程序特别繁琐，需要填写近百个表格及资料，不能有半点差错，否则不仅通过不了备案，反而耽误更多的时间。
我们是餐饮的连锁企业，以前自己尝试过备案，但后来还是没通过，最后找的是专业做备案的代理机构，好像叫宾侨国际，差不多3个月就完成备案了。
现在是商务部流通产业司在负责，你可以登录商务部官网查询
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