黑龙江重点大学有两类，一类是中央部委所属重点大学、另一类是黑龙江省属重点大学。
一、中央部委所署重点大学
哈尔滨工业大学
哈尔滨工程大学
东北林业大学
二、黑龙江省属重点大学
黑龙江省2008年8月发布的《黑龙江省高等教育强省建设规划》确定黑龙江省省属重点大学共10所，名单如下：
东北农业大学
哈尔滨医科大学
黑龙江大学
黑龙江中医药大学
大庆石油学院
哈尔滨理工大学
哈尔滨师范大学
哈尔滨商业大学
佳木斯大学
齐齐哈尔大学
黑龙江大学
佳木斯大学
齐齐哈尔大学
哈尔滨医科大学
哈尔滨理工大学
哈尔滨商业大学
哈尔滨师范大学
黑龙江科技学院
大庆石油学院
黑龙江八一农垦大学
黑龙江中医药大学
牡丹江医学院
齐齐哈尔医学院
黑龙江工程学院
哈尔滨学院
牡丹江师范学院
大庆师范学院
哈尔滨体育学院
绥化学院
黑龙江东方学院
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