你要详细看一下培训协议的条款，培训协议中有没有注明培训的内容？有没有注明培训一共花了多少钱？
法律规定，企业送员工外出参加专门知识、技能的培训才可以约定服务期，如果你在B公司知识参加了一些入职培训类的培训，是不能认为是专门知识技能的培训的。
另外，法律规定，如果服务期违约的话，所赔偿的费用不超过培训费总额，所以即使你要赔偿的话也要看你去培训一共花了多少钱，而不是协议里约定的两万元。
由于你提供的信息有限，只能帮你分析这么多。
根据协议文本和自己的离职原因，建议：
仔细研读协议文本相关条文，找出有利于你们离职原因的文字阐述，与公司协商解决；
向法律援助机构寻求帮助；
通过法庭调解；
按协议条文支付赔偿。
为保护自己的利益，争取将赔付减少到最低程度。
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