我在做overlap PCR,两个片段一条736bp,一条255bp,20个重叠碱基,四个引物的TM值都是59度,两条都P出来了

2025-01-31 02:46:40
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回答1:

你的设计有没有问题?重叠那段的引物是连接的关键,而这段引物一般比较长,Tm不会只有59。
建议用不对称PCR做第一轮,分别P出2个单链为主的产物,这样纯化容易;
然后用2端引物扩第二轮。这时的退火温度不是低,而是比较高,因为跨链。所以两端的引物也要符合这点要求,不能太短。

回答2:

试试把退火时间延长一些,看能不能把两条链连上。一般就是照着引物的Tm值做就可以的。