RT-PCR产物电泳结果只有引物二聚体,没有目的条带,更换引物了也这样,求高手解答原因啊!高分

2024-12-22 18:09:24
推荐回答(3个)
回答1:

1. 楼上说的都很有道理。不同的Taq确实效果很不一样。在我所使用过的几十种酶中,发现凡是遇到困难的模板,Qiagen 的HOTSTART MASTER MIX PLUS一般都可以得到产物,所以我强烈推荐(可以试试配合Q SOLUTION一起使用,一般免费索取)
2. 另外就是,你的目标基因的表达量是不是很低?你的PCR目的是什么?建议先找一个表达丰度高的体系,验证一下你的引物是否工作。对于极低表达丰度的目标,一轮PCR很有可能得不到产物,这是建议使用NESTED PCR,就是设计2套嵌套的引物,第一轮先用外面的那对,理论上可以得到一个比较大的产物(跑胶不一定能看到),然后稀释PCR产物50倍,再用里面那对引物扩一次,一般可以得到跑胶看得见的产物量。
3. 关于引物设计,推荐使用Primer3 plus,这是免费的网上设计软件,很好用。比你用的那2种引用次数多很多。你Google一下就可以了。

回答2:

个人觉得mix质量一般,mix一般是用来做检测用的,比如说提取出来了质粒做克隆鉴定啊,或者是转基因动物做基因型鉴定用的。你要用cDNA做模板的话,建议用专门的PCR的酶,这样也可以改体系中的不同组分,比如说可以把Mg离子浓度提高一些。
我建议你改用好一些的Taq酶去PCR试试,比如说LA Taq,Primer Star或者PFU什么的,保真度高。另外,你也可以试试把退火温度再降低一下,你的退火温度是在引物的Tm值附近的吗?

回答3:

不要用mix试试吧!

用Taq DNA buffer、dNTPs、Mg2+、引物、TaqDNA聚合酶试试。

退火温度在40到70度间都试试。可能是退火温度已经太低了所以出现杂带。