转基因作物检测大体分为两种：一是检测是否含有外源蛋白，即外源基因表达产物，主要采用酶联免疫吸附法和试纸条法；二是检测是否含有外源基因(DNA)，主要有Southern杂交技术、基因芯片法和PCR检测法。
主要基于两类，一类是基于蛋白的检测，另一类是基于核酸的检测。
基于蛋白的检测较少，主要原因是植物在加工过程中蛋白容易被破坏，而基于核酸的检测则相对稳定的多，主要就包括PCR，多重PCR，巢式PCR等等。
据我在数据库里搜索，国内做的比较好的是暨南大学的吴希阳教授，大家可以自己去google学术搜索一下，有很多篇他关于转基因检测的文章。
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