玉米穗腐病主要由串珠镰刀菌、青霉菌、曲霉菌等多种霉菌侵染所致。其中串珠镰刀菌是优势病原菌。
玉米种子带菌，病残体为初侵染源，主要是气流传染病害。传播途径，一是病原从玉米根部侵染，传到果穗再扩散到穗轴和籽粒。二是气流、雨水侵入花丝，花丝进入果穗内部侵染。三是玉米虫害等造成伤口病菌侵入。适温高湿发生重，重茬的比轮作的重，密植的重于稀植的。同一品种在同一年份同一栽培条件下，种植过密，寡照隐蔽，高温冷凉，通风差，地势低洼，偏施氮肥的发病重。品种果穗包裹严，籽粒不外漏、果穗下垂的轻；硬质、灌浆脱水速度快的品种感病轻。
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