1 预先已知到目的片段的大小,PCR跑胶验证该大小的片段是否跑出来,点Marker就可以区别;
2 预先未知到目的片段的大小,比如5‘RACE PCR,这将出现的片段(一般是最大的条带)克隆,测序,然后看是不是所要的带
电泳时一定让样品和Marker一起跑,根据位置确定片段大小,根据比对其他物种相应片段的大小,推测其是否可能是目的片段。 常用的DNA Marker有:λ / HindIII DL5000
还可以检测扩增的特异性。电泳时跟Marker一起跑,根据位置确定片段大小,根据比对其他物种相应片段的大小,推测其是否可能是目的片段,当然,最终的确定是根据测序结果。
----中国西部生命科学论坛
设计引物的时候你就应该知道是多大片段了啊,不然你的引物是怎么设计出来的?