工程管理硕士有三个方向，其中一个子方向是项目管理，并不特指工程项目，另外两个方向是物流供应链和电商信管。也就是说工程管理涵盖的范围比项目管理要广泛，另外还有几个明显的区别，感觉MEM优势更大。
1、MPM是单证的，MEM是双证，现在的单位逐渐开始只认双证了。
2、MPM学制最短2.5年，MEM学制2年
3、MPM不能落户调档，毕业不能推荐，无派遣证。南开MEM自愿落户调档，如果调档，毕业有派遣，学校可以做推荐。
4、MPM学费4.5万，MEM学费4.8万。
MEM主要是工程建筑领域的项目管理类，主要包含项目管理、合同管理等等，而MPM主要是管理类，并不特指工程建筑类的，所以我觉得你应该报MPM，会对你得工作有帮助。谢谢，你主要还是要看具体安排的课程。
方向区别:
南开大学的MEM（工程管理硕士）专业2015年考研招生简章招生目录
研究方向
01物流与供应链管理
02信息系统与电子商务
03工程项目管理
南开大学MPM（项目管理工程硕士）2015年考研招生简章招生目录
研究方向
01管理科学
02电子商务与企业信息化
03项目管理
04网络组织创新
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