A、二氧化硅破坏细胞结构,使研磨充分,加入少许碳酸钙可防止在研磨时色素被破坏,A错误;B、加入碳酸钙的作用防止液泡中酸性物质破坏色素,即防止色素被破坏,B错误;C、用层析液分离色素时不能让层析液没及滤液细线,防止色素溶解在层析液中,C正确;D、叶绿体中的色素都能溶解于有机溶剂中,如:丙酮(酒精)等,所以用丙酮提取叶绿体中的色素,D错误.故选:C.