Flag标签融合蛋白一般都是非变性表达的做WB的话，不管是否是变性蛋白，和SDS结合后都会打开原有的结构暴露出N端或者C端的标签，这样就有了抗原决定簇，抗Flag标签的抗体会和抗原决定簇起免疫反应。所以说作为抗原，是否变性都没关系的。
