我公司和别家公司共同开发一个项目，未经我公司同意对方私自申请知识产权保护，这种做法是否合法，我公司

第一，先给这件事情定性。
通常两家公司进行技术合作开发，要签合同的，在你叙述来看，你们似乎没有对这个申请权的归属作出约定。
参考的条文之一：合同法，第三百四十条规定，“合作开发完成的发明创造，除当事人另有约定的以外，申请专利的权利属于合作开发的当事人共有。当事人一方转让其共有的专利申请权的，其他各方享有以同等条件优先受让的权利。合作开发的当事人一方声明放弃其共有的专利申请权的，可以由另一方单独申请或者由其他各方共同申请。申请人取得专利权的，放弃专利申请权的一方可以免费实施该专利。合作开发的当事人一方不同意申请专利的，另一方或者其他各方不得申请专利。”
结合你讲得事实，依据此条文很明显看出，另一方是违法了。
第二，关于处理：另一方已经申请了知识产权保护，你可以带上相关资料到他申请知识产权的部门去提异议，由这个部门来审查。如果，在该公司申请了知识产权保护给你公司带来了损失，你们还可以提出要求其赔偿。

技术合同 合作开发
当事人一方不同意申请专利的，另一方不得申请专利。　　
申请人取得专利权的，放弃专利申请权的一方可以免费实施该专利。
当事人一方转让其共有的专利申请权的，其他各方享有以同等条件优先受让的权利。

你能做就是和他去商量.要不,就是找个律师.不然就没办法了
哈哈

你能做就是和他去商量.要不,就是找个律师.你没有办法了.