如果发生交通事故当时，你是在履行职务行为，那么，因交通事故所形成的一切法律责任应当由用人单位承担，也就是说，交害人只能要求用人单位进行赔偿。既然由用人单位来进行赔偿，用人单位当然可以与事故方进行协议处理。但，用人单位认为你的行为有过错的，可以要求你承担一定的补偿责任，但你需要承担的责任只与你的过错相关，与公司和对方协议处理交通事故无关。
因为你没有介绍发生交通事故的具体情况，因此，这样的提问很难获得有效的解答结果。从你的问题再结合社会经验猜测，你应该是发生交通事故的直接当事人，比如是公司驾驶员或在工作过程中发生交通事故，这种情况下，应该是由单位承担责任的。因此，公司就直接进行事故责任的处理，至于对你有没有影响，主要看你是否存在故意或重大过失，如果有，公司可以对你追偿。
那首先要看你在事故中有没有责任，再写要靠公司是怎么和对方签订的协议了，最好能看一看协议
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