A、萨顿推论出基因在染色体上运用的是类比推理法，A错误；B、研究光合作用产物中氧气的来源和有氧呼吸过程中氧元素的去路中都用到了同位素标记法，B正确；C、沃森和克里克运用模型法研究DNA分子的双螺旋结构，C错误；D、孟德尔遗传定律的发现运用了假说-演绎法，D错误．故选：B．
