首先，必须签一个三方抵账协议作为会计入账的依据，大体内容如下：
我公司欠甲公司货款 元，其明细如下 ……
乙公司欠我公司货款 元，其明细如下 ……
经过三方友好协商，同时为了避免较为繁琐的支付手续，现由乙公司直接将 元货款支付给甲公司，该协议则作为三方往来账款核销依据。 特此说明。
盖上三方的 公章，财务账，法人章（或者法人签字）。
其次，进行账务处理 ，直接根据抵账明细进行应收应付对冲 ，借 应付 甲 ……，贷 应收 乙……
就差不多ok了
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