如果公司的劳动纪律已经向你们宣读过或是公示过，内容是没有违反国家劳动法律规定的，那么对你们起作用。并不违法。但是扣了工资后，发到手的工资是不能低于所在城市的标准最低工资，否则用人单位就违法了。
有证据的话，没有办法。
