如何查基因引物的特异性,就是看我们的引物是不是对这个基因特异的,还是否存在于别的基因上?

2025-01-28 03:21:21
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回答1:

看你的引物是否落在别的基因上,类似于同源性blast。有两个方法可以来判断
1.NCBI工具_Primer-BLAST——NCBI的引物设计和特异性检验工具 NCBI工具_Primer-BLAST——NCBI的引物设计和特异性检验工具
2.ucsc 网站进行primer blast 。

回答2:

有专门的网站可以提供这个匹配,或者自己用BLAST什么的拿引物的序列去基因组里匹配一下就可以了吧大概。其实个人认为即使不是特异的,如果假阳性是长度更大并且差很多的序列在PCR时的影响不会太大