我现在是一名大二的GIS专业的学生，高考考砸了读了一个二本学校。自从我进校后就一直打算考研。

首先对于GIS专业，个人认为只有读研才有出路。对于你的问题如下参考：
对于第一个问题那个学校好？如下是全国排名：
地图学与地理信息系统专业的学校排名依次是：

A+ 武汉大学，南京师范大学，北京大学

A 北京师范大学，南京大学，中山大学，中国矿业大学，首都师范大学，华东师范大学，浙江大学，东北师范大学

B+（18个）中国海洋大学，中国农业大学，兰州大学，陕西师范大学，安徽师范大学，中南大学，北京林业大学，山东师范大学，新疆师范大学，广西师范大学，福州大学，同济大学，河南大学，河北师范大学，辽宁师范大学，昆明理工大学，成都理工大学，云南师范大学

对于第二个问题，大概有三个方向：
A,地图制图与地理信息技术应用
B遥感与地理信息应用
C地理信息技术工程
貌似是这三个，个人觉得貌似是看导师，方向在报考时关系不大，关键是看你跟的导师是什么方向。
对于第三个问题，我就暂时不回答了，留给楼下的。祝考研顺利。

个人认为，考清华比较理想。现在才大二，有的是时间。
还有，在我记忆中，清华本科没有GIS专业，这样就少了其本校本科竞争，机会大多了。当然，武汉的也不错，看自己的大四时候的实力吧。我建议还是不必现在就锁定自己，不然，大学会很累的。

考中国科大或者中国矿大比较好！大三开始准备就行，二本也没关系，只有下功夫了一般都能考上！

GIS专业的话考武大的GIS国家重点实验室最好