大便异常往往是肠道菌群失调的最常见表现：急性、慢性腹泻通常是外来的致病细菌（如各种痢疾杆菌）在肠道内大量生长繁殖的结果；拉稀和便秘时通常都伴随着肠道内双歧杆菌锐减。滥用抗生素可能抑制肠道中各种正常微生物生长，并引起耐药性菌株的滋长，从而引发严重的并发症。长期的菌群失调有可能导致各种疾病，特别是致病菌产生的有害、有毒物质，会促进人体衰老和加速癌变。
拉肚子。便秘。也有可能引起肥胖。内分泌失调。长痘痘。
肠道菌群失调常表现为：腹泻、腹胀。
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