A、功能及所合有机化合物都不相同,A错误;B、功能及所合有机化合物都不相同,B正确;C、细胞质基质、线粒体基质和叶绿体基质的功能不相同,所含有机化合物也不同,C错误;D、细胞质基质、线粒体基质和叶绿体基质的功能不相同,所含有机化合物也不同,D错误.故选:B.