根据国务院公积金条例，是按工资总额缴纳的。但实际操作上，很多机关事业单位是按照基本工资几个项目缴纳，主要是财政负担的问题，其实是不合法的。
住房公积金占工资比例计算：
每月住房公积缴存额由职工本人缴纳和单位为职工缴纳二部分组成，其计算方法是以"本人上一年度月平均工资"为基数和政策规定的缴存比例得出。即：
(1)职工本人住房公积金的月缴存额=职工本人上一年度月平均工资×职工住房公积金缴存比例;
(2)单位为职工缴存的住房公积金的月缴存额=职工本人上一年度月平均工资×单位住房公积金缴存比例。
职工本人上一年度月平均工资同，同当地社会平均月平均工资之比，低于60%的最低按当地社会平均月平均工资的60%计算，高于300%，最高按300%计算。
缴存比例(各地可能有差异)浙江为5%-12%之间。不实行住房补贴制度的地区和用人单位，以增加住房公积金缴存比例方式实行住房分配货币化改革的，可适当提高缴存比例，但最高不超过20%。
住房公积金，是指国家机关、国有企业、城镇集体企业、外商投资企业、城镇私营企业及其他城镇企业、事业单位、民办非企业单位、社会团体及其在职职工缴存的长期住房储金。具有强制性、互助性、保障性。单位和职工个人必须依法履行缴存住房公积金的义务。
扩展资料：
住房公积金提高个人缴存比例有什么好
如果你将个人比例提高到12%，则每月缴存额=1000元×(12%+8%)=200元。在单位比例不提高的情况下，一般来说单纯提高个人比例用处不大，甚至有负面意义。
因为你交的多，单位并未补贴你那么多，而且交到公积金账户的钱并不能完全自由使用，需要满足公积金提取条件才能使用，且公积金缴存的利率非常低)，但提高个人缴存比例也不是一无是处，会有以下效果：
1、通过提高个人缴存额来减少计算个人所得税金额，因为缴存比例在12%以下的部分是免于计算个税的，不过如果你收入只有1000元那根本谈不上个税的事情。
2、通过提高个人缴存额达到使公积金账户余额增长速度加快，这在某些申请公积金贷款时对账户余额有要求的城市(比如东莞申请公积金贷款就要求贷款额不得超过账户余额的8倍)还是有一定意义，不过如果你收入只有1000元那申请公积金贷款买房看来也是基本无望的事情。
参考资料来源：百度百科-住房公积金
参考资料来源：人民网-个人可缴存公积金 发挥公积金制度的住房保障功能